Ngày 17/12, Ban chấp hành Trung ương khóa XII quyết định khai trừ ông Nguyễn Đức Chung - nguyên Phó Bí thư Thành ủy, nguyên Chủ tịch UBND TP Hà Nội, ra khỏi Đảng.
Theo Uỷ ban Kiểm tra Trung ương, ông Chung đã vi phạm rất nghiêm trọng quy định của Đảng, pháp luật của Nhà nước về bảo vệ bí mật nhà nước, vi phạm quy định về những điều đảng viên không được làm, ảnh hưởng xấu đến uy tín của tổ chức đảng và cá nhân.
Bị kết tội chiếm đoạt tài liệu mật của vụ án Nhật Cường, ngày 11/12, cựu chủ tịch Hà Nội Nguyễn Đức Chung bị phạt 5 năm tù về tội Chiếm đoạt tài liệu bí mật nhà nước, theo điều 337 Bộ luật Hình sự.
Ủy viên Trung ương đầu tiên của khóa XII bị khai trừ là ông Đinh La Thăng. Ngày 9/5/2018, Hội nghị Trung ương 7 (khóa XII) đã xem xét và quyết định kỷ luật ông Đinh La Thăng - Uỷ viên Ban chấp hành Trung ương Đảng, Phó trưởng Ban kinh tế Trung ương, bằng hình thức khai trừ Đảng.
Tại kỳ họp thứ 24 vào cuối tháng 4/2018, căn cứ quy định của Đảng cũng như các bản án của Tòa án nhân dân thành phố Hà Nội, Ủy ban Kiểm tra Trung ương đề nghị Bộ Chính trị, Ban chấp hành Trung ương xem xét, thi hành kỷ luật ở mức cao nhất đối với ông Thăng.
Quyết định khai trừ Đảng nêu trên là lần thứ hai ông Thăng bị kỷ luật. Trước đó, ngày 7/5/2017, Hội nghị Trung ương 5 (khóa XII) đã kỷ luật ông Đinh La Thăng (lúc đó là Uỷ viên Bộ Chính trị, Bí thư Thành ủy TP HCM) bằng hình thức cảnh cáo, cho thôi chức Ủy viên Bộ Chính trị, với hơn 90% phiếu đồng ý.
Năm 2018, ông Thăng bị phạt 30 năm tù trong hai vụ án xảy ra tại Tổng Công ty cổ phần Xây lắp Dầu khí Việt Nam, Tập đoàn Dầu khí Việt Nam và Ngân hàng TMCP Đại Dương. Hồi đầu năm 2020, ông tiếp tục bị đề nghị truy tố trong vụ án chỉ định nhà thầu thực hiện dự án Ethanol Phú Thọ, gây thiệt hại hơn 600 tỷ đồng.
Hiện TAND TP HCM đang tiếp tục xét hỏi cựu bộ trưởng Giao thông Vận tải Đinh La Thăng về các cáo buộc sai phạm trong quá trình bán quyền thu phí cao tốc Trung Lương, dẫn đến việc Đinh Ngọc Hệ (tức Út "Trọc", 49 tuổi, nguyên phó giám đốc Tổng Công ty Thái Sơn, Bộ Quốc phòng) chiếm đoạt 725 tỷ đồng của nhà nước.
Cựu Bộ trưởng Thông tin Truyền thông Trương Minh Tuấn bị Trung ương khai trừ Đảng ngày 11/10/2019, trong phiên làm việc của hội nghị Trung ương lần thứ 11 (khoá XII), 7 tháng sau khi nhận quyết định khởi tố bị can.
Cuối tháng 9/2019, Ủy ban Kiểm tra Trung ương đề nghị Bộ Chính trị, Ban chấp hành Trung ương xem xét, khai trừ Đảng đối với ông Nguyễn Bắc Son - nguyên Ủy viên Trung ương Đảng khóa X, nguyên Phó trưởng Ban Tuyên giáo Trung ương và ông Trương Minh Tuấn - Ủy viên Trung ương Đảng, Phó trưởng Ban Tuyên giáo Trung ương, nguyên Bí thư Ban cán sự đảng, nguyên Bộ trưởng Thông tin Truyền thông.
Cơ quan kiểm tra đề nghị khai trừ Đảng do hai ông này "đã bị khởi tố, bắt tạm giam trong vụ án hình sự Mobifone mua 95% cổ phần của AVG".
Cuối tháng 12/2019, TAND TP Hà Nội tuyên phạt ông Nguyễn Bắc Son án tù chung thân về tội Nhận hối lộ, 16 năm tù do Vi phạm các quy định về quản lý đầu tư công, tổng hợp hình phạt là tù chung thân. Cùng tội danh, cựu bộ trưởng Thông tin và Truyền thông Trương Minh Tuấn nhận mức án lần lượt 8 và 6 năm tù, hình phạt chung 14 năm.
Ngoài các trường hợp bị khai trừ Đảng nêu trên, trong nhiệm kỳ khóa XII còn nhiều Ủy viên Trung ương khác nhận kỷ luật với các hình thức khác nhau.
Trong đó, ngày 6/10/2017, Ban chấp hành Trung ương kỷ luật ông Nguyễn Xuân Anh bằng hình thức: Cách chức Bí thư Thành ủy Đà Nẵng, Ủy viên Ban thường vụ, Ủy viên Ban chấp hành Đảng bộ thành phố Đà Nẵng nhiệm kỳ 2015-2020; và cho thôi giữ chức Ủy viên Ban chấp hành Trung ương Đảng khóa 12
Ngày 12/4/2018, Bộ Chính trị kỷ luật cảnh cáo ông Trần Quốc Cường - Ủy viên Trung ương Đảng, Phó bí thư Tỉnh uỷ Đắk Lắk, do những vi phạm, khuyết điểm trong thời gian giữ cương vị Bí thư Đảng uỷ, Cục trưởng Cục B41, Phó tổng cục trưởng Tổng cục 5, Bộ Công an (giai đoạn 2009-2012).
Ngày 26/12/2018, Hội nghị Trung ương 9, khóa XII, đã thông qua việc kỷ luật ông Tất Thành Cang (Phó bí thư thường trực Thành ủy TP.HCM) bằng hình thức: Cách chức Ủy viên Trung ương Đảng khoá XII, Phó bí thư thường trực Thành ủy, Ủy viên Ban Thường vụ Thành ủy TP HCM nhiệm kỳ 2015 - 2020.
Hôm 16/12, ông Tất Thành Cang bị Công an TP HCM bắt tạm giam về hành vi Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát lãng phí theo Điều 219 Bộ luật Hình sự.
Ngày 10/1/2020, Bộ Chính trị kỷ luật khiển trách ông Triệu Tài Vinh - Phó trưởng ban Kinh tế Trung ương, nguyên Bí thư Tỉnh ủy Hà Giang. Khi giữ cương vị Ủy viên Trung ương Đảng, Bí thư Tỉnh uỷ Hà Giang, ông Triệu Tài Vinh chịu trách nhiệm người đứng đầu Ban thường vụ Tỉnh ủy trong việc để xảy ra những vi phạm nghiêm trọng trong Kỳ thi Trung học Phổ thông quốc gia năm 2018 tại tỉnh Hà Giang.
Đầu năm 2020, khi đang là Ủy viên Bộ Chính, Bí thư Thành uỷ Hà Nội, ông Hoàng Trung Hải bị Bộ Chính trị cảnh cáo sau khi xem xét vi phạm của ông liên quan dự án mở rộng sản xuất giai đoạn II - Công ty Gang thép Thái Nguyên (dự án TISCO II).
Ngày 16/6, Bộ Chính trị quyết định kỷ luật cảnh cáo đối với ông Lê Viết Chữ, Bí thư Tỉnh ủy Quảng Ngãi, vì những sai phạm nghiêm trọng, ảnh hưởng xấu đến uy tín của cấp uỷ, chính quyền địa phương.
Ngày 8/11, Ủy viên Bộ Chính trị, Bí thư Trung ương Đảng Nguyễn Văn Bình (Trưởng ban Kinh tế Trung ương) bị cảnh cáo do các vi phạm trong giai đoạn làm Thống đốc Ngân hàng Nhà nước.