Cáo trạng được VKNSD Hà Nội ra ngày 24/6, gần 20 ngày sau khi Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an Hà Nội chuyển kết luận điều tra, đề nghị truy tố. Nhà chức trách cho biết đây là án điểm nên phiên tòa xét xử sẽ sớm được mở.
VKSND Hà Nội cáo buộc, khu đất ở cánh đồng Sênh ở xã Đồng Tâm (huyện Mỹ Đức, Hà Nội) là đất quốc phòng nhưng từ năm 2013 ông Lê Đình Kình cùng nhiều người đã lập "Tổ Đồng thuận" với mục đích chiếm lại để chia nhau. Họ kích động, kêu gọi người dân xã Đồng Tâm "đấu tranh để giữ đất".
Tháng 11/2019, biết thông tin Công an thành phố Hà Nội phối hợp với Quân chủng Phòng không – Không quân (Bộ Quốc phòng) triển khai bảo vệ lực lượng thi công xây dựng tường rào Sân bay Miếu Môn trên đất đồng Sênh, các bị can đã góp tiền mua 10 quả lựu đạn, làm 85 chai bom xăng, mua khoảng 10 tuýp sắt có gắn dao bầu và liềm... để tấn công lực lượng chức năng.
Video được phát trực tiếp trên mạng cho thấy, nhiều người trong nhóm của ông Kình đã đe doạ tấn công, tiêu diệt từ 300 đến 500 người nếu công an tiến vào Đồng Tâm.
Khoảng 3h ngày 9/1, biết công an triển khai lực lượng ở Đồng Tâm, nhóm này dùng Facebook phát trực tiếp thông báo kêu gọi dân làng cùng chống đối. Họ trèo lên mái nhà ông Kình và bắn pháo, ném "bom xăng", dao phóng lợn về phía cảnh sát, đánh kẻng báo động..
Tổ công tác đã nhiều lần dùng loa kêu gọi các bị can chấm dứt hành vi song sự chống đối càng quyết liệt. Bị can Lê Đình Chức và Lê Đình Công ném lựu đạn về phía tổ công tác đang thực hiện nhiệm vụ nhưng không nổ.
Đại tá Nguyễn Huy Thịnh (Phó trung đoàn trưởng Trung đoàn Cảnh sát cơ động thủ đô, Bộ Tư lệnh cảnh sát cơ động), thượng úy Dương Đức Hoàng Quân (Tiểu đoàn 1, Trung đoàn Cảnh sát cơ động thủ đô, Bộ Tư lệnh cảnh sát cơ động), đại úy Phạm Công Huy (cán bộ phòng Cảnh sát phòng cháy chữa cháy, Công an Hà Nội) cùng một số chiến sĩ đột kích vào nhà ông Kình từ nhiều hướng.
Khi anh Thịnh, anh Huy và anh Quân di chuyển để sang mái nhà bị can Chức thì bị ông ta dùng tuýp sắt gắn dao bầu chọc từ trên xuống. Những người khác ném bom xăng, gạch đá khiến ba chiến sĩ rơi xuống hố sâu 4 mét.
Bị can Chức đổ chậu xăng xuống hố, châm lửa đốt trong khi anh Thịnh, Huy, Quân đang ở phía dưới. Ba cảnh sát tử vong do ngạt khí và cháy than hóa toàn thân.
Tổ công tác áp sát phòng ngủ tầng một nhà ông Kình song đã bị ném tuýp sắt gắn dao bầu cùng một quả lựu đạn. Cảnh sát phá khóa cửa ngách, phát hiện ông Kình đang cầm một quả lựu đạn và hô hào chống đối nên bắn tiêu diệt.
Nhà chức trách xác định bị can Lê Đình Chức, Lê Đình Doanh, Lê Đình Uy tham gia tích cực và trực tiếp thực hiện hành vi giết người. Các bị can: Nguyễn Văn Quân, Lê Đình Quang, Bùi Thị Nối, Bùi Thị Đục, Trần Thị La, Nguyễn Văn Duệ, Nguyễn Thị Bét, Nguyễn Xuân Điều, Nguyễn Thị Lụa, Đào Thị Kim, Lê Đình Quân, Bùi Văn Tiến, Bùi Văn Tuấn, Trịnh Văn Hải, Bùi Văn Niên, Mai Thị Phần, Lê Thị Loan và Nguyễn Văn Trung bị Lê Đình Kình, Lê Đình Công và Bùi Viết Hiểu xúi giục, lôi kéo, kích động nên đã tham gia với vai trò đồng phạm, giúp sức.
Lê Đình Hiển, Bùi Viết Tiến, Nguyễn Thị Dung và Trần Thị Phượng bị lôi kéo, kích động nên tham gia chống đối lực lượng công an, bị truy tố về tội Chống người thi hành công vụ.