Tai nạn xảy ra tại km 20+675 khu gian Chợ Tia - Thường Tín khi tàu SE2 đang chạy hướng Nam - Bắc. Tại hiện trường, xe container văng ra sát đường sắt, đầu xe và tàu hỏa đều hư hỏng nặng, may mắn không có thiệt hại về người.
Đoàn tàu không bị trật bánh nhưng toàn bộ thiết bị chắn đường ngang bị hỏng.
Theo Ban An toàn giao thông (Tổng công ty Đường sắt Việt Nam), vị trí xảy ra tai nạn là đường ngang dân sinh đã được lắp đèn cảnh báo và barie chắn tự động, không có người gác. Thiết bị cảnh báo hoạt động bình thường vào thời điểm xảy ra tai nạn.
Kết quả điều tra ban đầu cho thấy tài xế cố tình lái xe container vượt qua rào chắn khi đã có đèn cảnh báo.
Lực lượng cứu hộ đã kéo đầu máy SE2 bị hỏng về ga Thường Tín và bố trí đầu máy khác kéo đoàn tàu về ga Hà Nội. Đến 7h sáng, đoạn đường sắt qua Thường Tín đã thông tàu.