Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch sử dụng tổ hợp xét tuyển các ngành B00 (Toán, Hóa, Sinh) cho tất cả ngành. Nếu các thí sinh có cùng mức điểm, trường dùng tiêu chí phụ theo thứ tự sau: điểm thi tốt nghiệp THPT quốc gia môn Ngoại ngữ; điểm trung bình chung lớp 12; điểm thi tốt nghiệp THPT môn Văn.
Mã ngành "TP" dành cho thí sinh có hộ khẩu TP HCM, mã ngành "TQ" là ngoài thành phố. Điểm chuẩn cao nhất 25,15 ở ngành Răng Hàm Mặt, áp dụng cho thí sinh các tỉnh thành khác.
Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch năm nay có 1.350 chỉ tiêu đại học chính quy, phân bố 50% cho thí sinh có hộ khẩu TP HCM, còn lại cho các tỉnh thành khác.