Là hệ điều hành có kiến trúc siêu nhỏ, QNX được ứng dụng nhiều trong quân sự và công nghệ xe hơi tiên tiến. Với kiến trúc này, nó có lợi thế hơn hẳn các hệ điều hành nguyên khối như Unix, Mac OS và Windows vì dễ dàng duy trì, an toàn và linh hoạt hơn.
