Ngày 4/6, UBND tỉnh Sơn La ban hành quyết định phân công ông Lê Hồng Minh, Phó chủ tịch tỉnh làm Trưởng ban chỉ đạo thay ông Phạm Văn Thủy. Tỉnh Sơn La cũng bổ sung ông Tô Hoàng, Trưởng phòng An ninh chính trị nội bộ (PA03), Công an tỉnh làm ủy viên Ban chỉ đạo thi.
Ông Lê Hồng Minh (52 tuổi), mới được bầu làm Phó chủ tịch Sơn La từ tháng 3/2019. Ông là kỹ sư xây dựng, cử nhân lý luận chính trị.
Theo quyết định thành lập ngày 21/5, Ban chỉ đạo thi THPT quốc gia tỉnh Sơn La năm 2019 gồm 45 người. Ông Phạm Văn Thủy, Phó chủ tịch tỉnh là Trưởng ban; ông Nguyễn Văn Chiến, Phó giám đốc Sở Giáo dục và Đào tạo mới được bổ nhiệm làm Phó ban thường trực.
Tại kỳ họp thứ 36 (tháng 5/2019), Ủy ban Kiểm tra Trung ương kết luận, ông Phạm Văn Thủy, Phó chủ tịch tỉnh Sơn La, Trưởng ban chỉ đạo thi THPT 2018 và ông Hoàng Tiến Đức, Giám đốc Sở Giáo dục và Đào tạo, Trưởng ban chấm thi THPT chịu trách nhiệm chính về những vi phạm trong công tác tổ chức kỳ thi THPT quốc gia năm 2018 tại tỉnh Sơn La.
Ủy ban Kiểm tra Trung ương nhận định, những vi phạm đó "gây hậu quả rất nghiêm trọng, ảnh hưởng xấu đến uy tín của cấp ủy, chính quyền địa phương và ngành giáo dục, gây bức xúc trong xã hội, để nhiều cán bộ, đảng viên liên quan bị xử lý hình sự".
Vì vậy, ông Phạm Văn Thủy bị cảnh cáo, ông Hoàng Tiến Đức bị xem xét, thi hành kỷ luật.
Tại kỳ thi THPT quốc gia 2018, Sơn La xảy ra gian lận điểm thi. Đến tháng 3/2019, Bộ Công an, Bộ Giáo dục và Đào tạo mới có kết luận điều tra, công bố điểm chấm thẩm định. Kết quả, 44 thí sinh với 95 bài trắc nghiệm và hai bài thi Ngữ văn có điểm chấm thẩm định thấp hơn so với điểm công bố. Thí sinh được nâng nhiều nhất là 26,55 điểm, bài thi có điểm nâng cao nhất là 9.
Ngày 24/5, đại diện VKSND tỉnh Sơn La cho biết theo kết luận điều tra vụ gian lận điểm thi THPT năm 2018, 8 người bị đề nghị truy tố về tội Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ theo điều 356 Bộ luật Hình sự 2015.
Cuối tháng 5/2019, Ban thường vụ Tỉnh ủy Sơn La khai trừ đảng ông Trần Xuân Yến, Phó giám đốc Sở Giáo dục và Đào tạo; Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Sơn La khai trừ 7 bị can liên quan gian lận thi cử THPT quốc gia 2018.