Sau thời gian thử nghiệm, Samsung đã chính thức phát hành Android 6.0 Marshmallow cho Galaxy S6 và S6 edge. Hàn Quốc là thị trường đầu tiên nhận được nâng cấp đáng giá này, trong khi đó tại những khu vực khác sẽ sớm cho tải về phiên bản mới.
Những cải tiến được mang lên bộ đôi Galaxy S6 trong bản cập nhật gồm Now and Tap - tính năng bấm giữ nút Home để xem thông tin theo ngữ cảnh, Doze and App Standby nhằm tăng thời lượng pin bằng cách đưa điện thoại vào chế độ "ngủ" khi không dùng đến. Ngoài ra, với Android 6.0 thì smartphone của Samsung sẽ được tăng cường bảo mật, cho phép đăng nhập vào các ứng dụng bằng vân tay.
Riêng với Galaxy S6 edge, hệ điều hành mới nhất cho phép màn hình cong hiển thị nhiều thông tin hơn, tăng từ 260 lên 550 pixel bề rộng. Đồng thời, nhà sản xuất Hàn Quốc cũng thêm các tính năng mới để tận dụng lợi thế mà màn hình cong đem lại.
Một số hiệu chỉnh được Samsung đưa ra gồm Apps edge tăng từ 5 ứng dụng lên 10, bổ sung Task edge cho phép truy cập nhanh vào các tác vụ mà người dùng thiết lập. Trong khi đó, Quick tool sẽ biến chiếc Galaxy S6 edge thành bộ công cụ đa chức năng như thước kẻ, la bàn hay bật tắt nhanh đèn flash...