Bảo tàng Chứng tích chiến tranh tiền thân là Nhà trưng bày tội ác chiến tranh xâm lược, mở cửa từ sau ngày đất nước thống nhất 30/4/1975. Đây là bảo tàng chuyên đề nghiên cứu, sưu tầm, lưu trữ và trưng bày những tư liệu, hiện vật về chứng tích tội ác và hậu quả của các cuộc chiến tranh ở Việt Nam.
Bảo tàng hiện lưu giữ hơn 20.000 tài liệu, hiện vật và phim ảnh; đã đón tiếp trên 15 triệu lượt khách tham quan.

Một phòng trưng bày của Bảo tàng Chứng tích chiến tranh. Ảnh: baotangchungtichchientranh.vn.
TP HCM hiện có những bảo tàng khác lưu giữ tư liệu về chiến tranh như: Bảo tàng Quân khu 7 (hay Bảo tàng Lực lượng vũ trang miền Đông Nam Bộ, thuộc Cục Chính trị - Quân khu 7), Bảo tàng Chiến dịch Hồ Chí Minh, Bảo tàng Không quân phía Nam...
Ngoài ra, thành phố còn có Bảo tàng Địa chất, thành lập từ năm 1953, đang trưng bày hơn 9.500 mẫu vật về địa tầng, magma, hóa thạch, khảo cổ. Trong kho bảo tàng hiện có 115 nghìn mẫu vật địa chất quý, 52 tài liệu gốc và hơn 1.000 bộ báo cáo khoa học về địa chất.