Dự án tọa lạc tại số 5 Tôn Đức Thắng, phường Bến Nghé, quận 1, vốn đầu tư 275 tỷ đồng, khởi công từ năm 2020 song gián đoạn vì Covid-19. Đây là một trong những công trình tiêu biểu của thành phố chào mừng kỷ niệm 50 năm Ngày thống nhất đất nước (30/4/1975-30/4/2025).
Công trình gồm 4 tầng nổi và một tầng hầm, tổng diện tích hơn 8.500 m2. Sau khi hoàn thành, bảo tàng trưng bày các chủ đề liên quan cuộc đời Chủ tịch nước Tôn Đức Thắng qua các giai đoạn, với khoảng 1.000 hiện vật và hình ảnh. So với bảo tàng cũ, diện tích trưng bày của công trình mới lớn gấp 5 lần, có ứng dụng công nghệ giúp giới thiệu sinh động các hình ảnh đến người xem.
Phát biểu tại lễ khánh thành, Chủ tịch UBND TP HCM Phan Văn Mãi nói công trình bảo tàng không chỉ là tấm lòng của Đảng bộ, chính quyền và nhân dân TP HCM mà còn tình cảm yêu mến của An Giang đối với Chủ tịch Tôn Đức Thắng.
Bảo tàng Tôn Đức Thắng thành lập năm 1988 nhân dịp kỷ niệm 100 năm ngày sinh của ông với tên gọi ban đầu là Nhà trưng bày cuộc đời và sự nghiệp Chủ tịch Tôn Đức Thắng. Bảo tàng có 5 phòng trưng bày, từ khi thành lập đã đón hơn 1,5 triệu lượt khách trong và ngoài nước tham quan.
Chủ tịch Tôn Đức Thắng (1888-1980) quê ở An Giang, là nhà cách mạng nổi tiếng, giữ vai trò chủ chốt trong cuộc bãi công của công nhân Ba Son diễn ra năm 1925 phản đối thực dân Pháp. Ông là Chủ tịch nước thứ hai của Việt Nam từ năm 1969 đến 1980, trước đó là Phó chủ tịch nước giai đoạn 1960-1969. Ông thường được người dân gọi thân mật là Bác Tôn.
Lê Tuyết