Công ty TNHH MTV Thoát nước Hà Nội cho biết 6 quận và 2 huyện có lượng mưa trên 100 mm. Trong đó quận Thanh Xuân 154 mm; Hoàng Mai 126 mm; Ba Đình 102 mm; Hai Bà Trưng 115 mm; Nam Từ Liêm 106 mm; Hà Đông 104 mm; Đông Anh 229 mm; Thanh Trì 113 mm.
Mưa lớn trong bối cảnh hệ thống ao, hồ, sông đang đầy nước do ảnh hưởng của hoàn lưu bão Yagi khiến hàng loạt tuyến phố bị ngập 20-50 cm.
Đoạn đường Nguyễn Trãi qua quận Thanh Xuân và Đống Đa hướng vào nội thành và ra ngoại thành đều bị ngập kéo dài gần một km. Riêng đoạn từ cổng Đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn đến điểm giao cắt với đường Nguyễn Tuân ngập gần 50 cm. Nhiều ngõ nhỏ ven đường cũng ngập, nước tràn vào nhà dân.
Tuyến đường ngập sâu đúng giờ cao điểm người dân đi làm, trẻ em đi học khiến giao thông bị ùn tắc cả hai chiều. Nhiều người cố lao qua điểm ngập úng khiến ôtô, xe máy chết máy hàng loạt.
Công ty TNHH MTV Thoát nước Hà Nội thống kê đến 6h30 địa bàn có trên 40 điểm ngập do mưa lớn. Lưu vực sông Tô Lịch có phố Thái Hà, Quan Nhân, Bùi Xương Trạch, Vương Thừa Vũ, Nguyễn Tuân, Cự Lộc, Nguyễn Khuyến, ngã 3 Điện Biên Phủ - Nguyễn Tri Phương, Liên Trì - Nguyễn Gia Thiều, 155 Phùng Hưng, Phan Bội Châu - Lý Thường Kiệt, Thụy Khuê, Cao Bá Quát bị ngập.
Lưu vực sông Cầu Bây bị ngập gầm chui xe lửa phố Thiên Đức, Nam Đuống, ngõ 80 Hoa Lâm, Cổ Linh, Đàm Quang Trung, Vũ Xuân Thiều, Ngọc Lâm.
Lưu vực sông Nhuệ các đường ngập gồm: Đại lộ Thăng Long (ngã ba giao Lê Trọng Tấn), hầm chui số 3, số 5, số 6, Triều Khúc, Cầu Bươu, Yên Xá, khu Tổng cục V - Bộ Công An, đường Tố Hữu, Yên Nghĩa (bến xe Yên Nghĩa tới ngã ba Ba La), đường Quyết Thắng, Võ Chí Công, Phú Xá, Hoa Bằng, Phùng Khoang, Lê Lợi - Trần Hưng Đạo, Quang Trung (trước cổng trường Nguyễn Huệ và đối điện ga La Khê), Tô Hiệu, đường Quyết Thắng.
Công ty TNHH MTV Thoát nước Hà Nội đã vận hành các cửa hồ điều hòa Đống Đa, Bảy Mẫu, Đầm Chuối và trạm bơm đầu mối Yên Sở, Đồng Bông 1, Đồng Bông 2, Cổ Nhuế, đồng thời ứng trực, vớt rác miệng cống để tiêu thoát nước.
Theo Trung tâm Dự báo Khí tượng Thủy văn quốc gia, do ảnh hưởng của dải hội tụ kết hợp với áp cao lục địa tăng cường, từ đêm 15/9 đến đêm 17/9, Hà Nội cũng như nhiều tỉnh miền Bắc mưa rào và giông rải rác.
Võ Hải