Quốc kỳ Mexico có thể chịu ảnh hưởng bởi cờ ba màu của Pháp, nhưng màu sắc mang đặc trưng quốc gia. Theo Britannica, màu xanh lá cây thể hiện sự độc lập, màu trắng dành cho Công giáo La Mã - tôn giáo chính ở Mexico và màu đỏ là sự đoàn kết.
Biểu tượng ở trung tâm quốc kỳ là con đại bàng trong huyền thoại của người Aztec cổ. Truyện kể rằng, người của bộ tộc nhìn thấy con đại bàng quắp theo con rắn đậu xuống nơi nào thì đó chính là nơi thuận lợi để lập kinh đô, tức Tenochtitlán (thành phố Mexico ngày nay).
Hình ảnh in trên quốc kỳ được biến tấu qua nhiều năm dưới các chế độ, thể hiện sự thay đổi về triết lý chính trị. Ví dụ, giai đoạn 1821-1823 và 1864-1867, Mexico là một đế quốc và đại bàng trên quốc kỳ đã được đội vương miện. Phiên bản quốc kỳ hiện tại được công nhận vào ngày 17 tháng 9 năm 1968.