Theo kết quả điều tra, năm 1994 khi giữ chức Phó chủ tịch UBND tỉnh Minh Hải cũ, Lê Công Nghiệp đã chỉ đạo sai nguyên tắc, giúp Công ty Dịch vụ thương mại Cà Mau và Công ty Xây dựng thủy lợi Cà Mau trong nhiều vụ làm ăn phi pháp, chiếm đoạt tiền của nhà nước. Đổi lại, bị can Lê Công Nghiệp được giúp đỡ tài chính để mua nhà số 28 Phan Bội Châu, phường 7, thành phố Cà Mau...
Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an xác minh, bị can Lê Công Nghiệp còn có một số sai phạm khác như ký duyệt cho Công ty Dược và kinh doanh XNK Minh Hải (do Nguyễn Hùng Tấn làm giám đốc) mua máy sấy tầng sôi, không thông qua cơ quan chức năng. Do vậy đã tạo điều kiện cho Nguyễn Hùng Tấn và đồng bọn nâng khống giá mua từ 10 triệu lên 1,6 tỷ đồng. Bị can Lê Công Nghiệp cũng ký bảo lãnh cho Công ty Dịch vụ thương mại Cà Mau vay hơn 12 tỷ đồng vốn ngắn hạn của ngân hàng để đầu tư vào xây dựng cơ bản. Khoản tiền này đến nay không có khả năng thu hồi…
Tháng 8/2002, Lê Công Nghiệp bị khởi tố về tội lợi dụng chức vụ, quyền hạn gây ảnh hưởng với người khác để trục lợi. Tháng 3/2003, VKSND Tối cao truy tố bị can Lê Công Nghiệp về tội danh trên. Ba tháng sau, tòa án ra quyết định trả hồ sơ để điều tra bổ sung làm rõ hơn sai phạm của bị can.
(Theo Sài Gòn Giải Phóng)