Theo quyết định thành lập, khu bảo tồn có các phân khu chức năng diện tích 18.000 ha gồm: khu bảo vệ nghiêm ngặt 3.000 ha, khu phục hồi sinh thái 11.230 ha và khu dịch vụ - hành chính 3.970 ha; cùng vùng đệm 9.000 ha.
Việc lập khu bảo tồn nhằm bảo vệ và bảo tồn nguồn lợi thủy sản, các loài sinh vật biển, loài quý hiếm nguy cơ tuyệt chủng, loài có giá trị kinh tế và khoa học sống trong khu; bảo vệ môi trường và hệ sinh thái, cảnh quan tự nhiên; đa dạng sinh học biển gắn với phát triển du lịch sinh thái bền vững, cải thiện sinh kế của cộng đồng ngư dân địa phương.
Tỉnh sẽ ưu tiên xây dựng kết cấu hạ tầng thiết yếu như thả phao ranh giới các phân khu chức năng và khu bảo tồn biển; xây dựng trụ sở làm việc và mua sắm trang thiết bị phục vụ công tác quản lý. Bên cạnh đó, cơ quan chức năng tổ chức tuyên truyền về bảo vệ môi trường biển và bảo tồn đang dạng sinh học; hỗ trợ tái định cư và chuyển đổi nghề kết hợp phát triển du lịch sinh thái.
Trước mắt, Cà Mau giao Chi cục Kiểm ngư các đơn vị liên quan tổ chức quản lý khu bảo tồn biển trên địa bàn theo quy định. Về lâu dài, khi khu bảo tồn đủ điều kiện sẽ đề xuất thành lập Ban Quản lý Khu bảo tồn biển.
Ðến năm 2023, cả nước có 178 khu bảo tồn thiên nhiên, trong đó có 34 vườn quốc gia; 59 khu dự trữ thiên nhiên; 23 khu bảo tồn loài và sinh cảnh; và 62 khu bảo vệ cảnh quan. Ngoài ra, cả nước có 9 khu đất ngập nước được công nhận là khu Ramsar thế giới và hơn 20 địa phương phê duyệt quy hoạch bảo tồn đa dạng sinh học cấp tỉnh, thành phố.
An Minh