M5s cũng sử dụng màn hình 5,5 inch độ phân giải Full HD. Máy chạy Android 6 với giao diện FlymeOS đặc trưng của Meizu.
Máy có thiết kế tương tự như M5 Note nhưng mỏng hơn đồng thời điểm khác biệt là phần viền ăng-ten.
M5s được trang bị chip xử lý 8 nhân MediaTek MT6753, RAM 3 GB và bộ nhớ trong 32 GB.
Máy hỗ trợ 2 sim 2 sóng với kết nối 4G LTE.
Loa ngoài và cổng microUSB nằm dưới đế máy.
Phía trên đỉnh máy có giắc cắm tai nghe. Pin của M5s chỉ có dung lượng 3.000 mAh nhưng có hỗ trợ sạc nhanh.