Không đồng tình với phán quyết của Ban Kỷ luật VFF về việc trừ bốn điểm do thi đấu tiêu cực trong trận thua KienlongbankKiên Giang với tỷ số 1-3, chiều 20/8/2013, Chủ tịch CLB XM Xuân Thành Sài Gòn - Nguyễn Xuân Thủy - ra thông báo không tham dự hai vòng đấu cuối V-League.

Lãnh đạo CLB XM Xuân Thành Sài Gòn cho rằng họ đã đầu tư rất nhiều tiền của, công sức vào đội bóng nhưng VFF và Công ty CP Bóng đá chuyên nghiệp Việt Nam (VPF) không mang đến sân chơi công bằng cho các đội tham dự, đặc biệt làm ảnh hưởng đến uy tín, hình ảnh của nhà tài trợ là Tập đoàn Xuân Thành.

Ban kỷ luật VFF sau đó phạt đội bóng này 100 triệu đồng, đánh tụt xuống hạng Ba. Bầu Thuỷ bị cấm tham gia các hoạt động bóng đá trong 5 năm.

Năm 2014, trong trận đấu giữa SLNA và An Giang trên sân Vinh, hậu vệ Trần Đình Đồng cũng đã có pha vào bóng bằng cả hai chân khiến cầu thủ Nguyễn Anh Hùng của đội khách bị gãy xương ống đồng và phải mất tới một năm điều trị.

Hậu vệ của SLNA sau đó bị cấm thi đấu chín tháng. Đây là án phạt kỷ lục của bóng đá Việt Nam và đã được rất nhiều tờ báo nổi tiếng trên thế giới như BBC, Reuters, Dailymail… đăng tải. Đình Đồng sau đó được giảm án xuống còn sáu tháng.

Trần Mạnh Dũng, Lê Quang Hùng, Lê Văn Duyệt, Nguyễn Gia Từ, Nguyễn Văn Hưng, Chu Ngọc Anh, Phan Anh Tuấn, Phạm Xuân Phú và thủ môn Trần Mạnh Dũng bị phát hiện dàn xếp tỷ số trong trận đấu với Kelatan tại AFC Cup ngày 18/3/2014.

Sau khi vụ việc bị vỡ lở, CLB Ninh Bình giải thể, còn chín cầu thủ kể trên bị VFF cấm thi đấu vĩnh viễn.

Theo cáo trạng ngày 17/3/2014, khi đã có mặt ở Malaysia để chuẩn bị cho trận đấu, Trần Mạnh Dũng rủ các cầu thủ Nguyễn Mạnh Dũng, Lê Quang Hùng,  Lê Văn Duyệt, các hậu vệ Phạm Xuân Phú, Chu Ngọc Anh, Nguyễn Gia Từ, tiền đạo Phan Anh Tuấn và thủ môn Nguyễn Văn Hưng họp bàn rồi thống nhất tham gia cá độ trận đấu giữa đội nhà với đội Kelantan, bằng hình thức bắt kèo "tài ba hòa" (trận đấu có trên ba bàn thì ăn, dưới ba bàn thì thua và ba bàn thì không phải trả tiền). Số tiền cá độ là hai tỷ đồng. Nếu thất bại, các cầu thủ sẽ chung tiền để trả, còn nếu thắng thì chia nhau. Trần Mạnh Dũng và Nguyễn Mạnh Dũng sau đó dùng điện thoại di động lắp sim của Malaysia liên lạc với đối tượng Đào Đức Lợi (sinh năm 1978, trú tại An Hưng, An Dương, Hải Phòng) để đặt độ. 

Ngày 18/3, trước khi ra sân, Trần Mạnh Dũng gọi điện để đặt độ nhưng Lợi chỉ nhận độ với số tiền một tỷ và hai mươi triệu đồng. Trận này, Ninh Bình thắng với tỷ số 3-2, và các đối tượng trên thắng 800 triệu đồng.

Hôm sau đội bóng về TP HCM, Trần Mạnh Dũng gọi điện yêu cầu Lợi chuyển tiền thắng độ. Để tránh bị phát hiện, Lợi bảo Trần Mạnh Dũng nhờ người khác ở TP HCM nhận hộ tiền, còn Lợi thông qua tiệm vàng ở Hải Phòng chuyển tiền vào khách sạn Nhật Hạ. Không có người quen ở TP HCM, Trần Mạnh Dũng trao đổi lại với Nguyễn Mạnh Dũng và thủ môn này đã bạn là Trần Công Thành (sinh năm 1981, trú tại phường Phạm Thái Bình, Quận 1) lấy hộ số tiền 800 triệu đồng. Sau khi nhận được số tiền trên, Nguyễn Mạnh Dũng đưa lại cho Trần Mạnh Dũng để chia cho những người cùng tham gia cá độ.

Vòng 3 V-League 2016, Omar giơ tay trêu tức khán giả Nha Trang khi bị truất quyền thi đấu. VFF tuyên phạt thủ quân của Thanh Hoá 30 triệu đồng và treo giò tám trận.

Sau khi khiếu nại, án phạt rút xuống còn 6 trận và 30 triệu đồng. Trước đó tại V-League 2009, cầu thủ Danh Ngọc của Nam Định từng bị treo giò 6 trận vì giơ “ngón tay thối” về phía CĐV Thể Công.

Thủ thành Minh Nhựt và đội trưởng Huỳnh Quang Thanh nhận án phạt nặng vì hành vi phản ứng trọng tài, xúi giục các đồng đội bỏ thi đấu trong trận gặp TP HCM ở vòng sáu giải V-League 2017.

Sau khi bị trọng tài Nguyễn Trọng Thư thổi phạt đền phút 80, khi tỷ số đang là 2-2, đội khác đã bỏ ra khỏi sân. Khoảng bảy phút sau, họ trở lại nhưng không có biểu hiện tiếp tục thi đấu. Thủ thành Minh Nhựt đã quay lưng lại khi Victor đá phạt đền. Sau khi giao bóng giữa sân, các đồng đội của anh cố tình chuyền cho đối thủ rồi đứng im, để TP HCM ghi thêm hai bàn và giành chiến thắng 5-2.